Ulf Ryde, född 9 december 1963 i Lund, är en svensk professor i teoretisk kemi[1].

Ulf Ryde tog kandidatexamen 1986 vid Lunds Universitet och disputerade i biokemi 1991 vid Lunds Universitet[2] med Per-Åke Albertsson som handledare. Som postdoc flyttade han till avdelningen för teoretisk kemi där han arbetade med Björn Roos. Blev docent i teoretisk kemi 1996.

Ryde är sedan 2004 professor vid Lunds Universitet. Han studerar biokemiska system med teoretiska metoder, särskilt på mekanismer för metallenzym,[3][4][5][6] läkemedelsutveckling,[7][8] kombinerade kvantmekaniska och molekylmekaniska metoder (QM/MM)[9] och kombinationer av kvantkemi och röntgenkristallografi.[10]

Han var rådsforskare i biooorganisk kemivetenskapsrådet 2001-2007.

Han är amatörbotaniker med krypbjörnbär som specialitet.[11] Har namngivit sex arter i Sverige, steningebjörnbär, ugglarpbjörnbär, onsalabjörnbär, rydetbjörnbär, buerabjörnbär och söndrumsbjörnbär.[12]

Referenser redigera

  1. ^ Ulf Ryde på Lunds universitets webbplats
  2. ^ U. Ryde-Pettersson, 1991 (på engelska) "A theoretical treatment of damped oscillations in biochemical reaction systems with applications to the photosynthetic oscillations". Ph. D. Thesis, University of Lund. Libris http://libris.kb.se/bib/7443773
  3. ^ U. Ryde, M. H. M. Olsson, B. O. Roos, K. Pierloot, J. O. A. De Kerpel (2000) "On the role of strain in blue copper proteins". J. Biol. Inorg. Chem., 5, 565-574. DOI 10.1007/s007750000147
  4. ^ K P. Jensen, U. Ryde (2009) "Cobalamins uncovered by modern electronic structure calculations", Coord. Chem. Rev., 253. 769-778
  5. ^ Rulíšek, L.; Ryde, U. "Theoretical studies of the active-site structure, spectroscopic and thermodynamic properties, and reaction mechanism of multicopper oxidases", Coord. Chem. Rev., 2013, 257, 445-458
  6. ^ U. Ryde, G. Dong, J. Li, M. Feldt, R. A. Mata (2016) "Computational studies of molybdenum and tungsten enzymes" In Molybdenum and Tungsten Enzymes, Eds. R. Hille, M. Kirk, C. Schulzke, RSC Metallobiology series no. 7; pp. 275-321
  7. ^ S. Genheden, U. Ryde (2015) "The MM/PBSA and MM/GBSA methods to estimate ligand-binding affinities" Expert Opinion Drug Discov., 10, 449-461; DOI: 10.1517/17460441.2015.1032936
  8. ^ U. Ryde, P. Söderhjelm (2016) "Ligand-binding affinity estimates supported by quantum-mechanical methods", Chem. Rev. 116, 5520-5566; DOI 10.1021/acs.chemrev.5b00630
  9. ^ U. Ryde (2016) QM/MM calculations on proteins. Meth. Enz., 577, 119-158; DOI: 10.1016/bs.mie.2016.05.014.
  10. ^ U. Ryde (2007) "Accurate metal-site structures in proteins obtained by combining experimental data and quantum chemistry", Dalton Trans., 2007, 607-625, DOI: 10.1039/b614448a
  11. ^ U. Ryde (2011-2018) Krypbjörnbär i Sverige, http://signe.teokem.lu.se/~ulf/Rubus_html/index.html Arkiverad 2 oktober 2017 hämtat från the Wayback Machine.
  12. ^ U. Ryde (2011) Arguments for a narrow species concept in Rubus sect. Corylifolii. Nord. J. Bot. 29, 708-726