Jonas Charisius, född 1571, död 1619, var en dansk diplomat. Jonas Charisius var far till Peder Charisius.

Charisius var från 1598 sekreterare i kansliet och så småningom kungligt råd, och användes av Kristian IV i en rad beskickningar och var särskilt inom handelns område en auktoritet. Han hade stora framgångar som diplomat.

Källor redigera