Originalfil(SVG-fil, standardstorlek: 481 × 415 pixlar, filstorlek: 20 kbyte)

Beskrivning

Figure. Evolutionary relationships of Boidinia and Gloeopeniophorella
The evolutionary history was inferred using the Minimum Evolution method [1]. The optimal tree with the sum of branch length = 0.44296624 is shown. The percentage of replicate trees in which the associated taxa clustered together in the bootstrap test (1000 replicates) are shown next to the branches [2]. The tree is drawn to scale, with branch lengths in the same units as those of the evolutionary distances used to infer the phylogenetic tree. The evolutionary distances were computed using the Kimura 2-parameter method [3] and are in the units of the number of base substitutions per site. The ME tree was searched using the Close-Neighbor-Interchange (CNI) algorithm [4] at a search level of 2. The Neighbor-joining algorithm [5] was used to generate the initial tree. The analysis involved 17 nucleotide sequences. All positions with less than 95% site coverage were eliminated. That is, fewer than 5% alignment gaps, missing data, and ambiguous bases were allowed at any position. There were a total of 1188 positions in the final dataset. Evolutionary analyses were conducted in MEGA6 [6]


1. Rzhetsky A. and Nei M. (1992). A simple method for estimating and testing minimum evolution trees. Molecular Biology and Evolution 9:945-967.
2. Felsenstein J. (1985). Confidence limits on phylogenies: An approach using the bootstrap. Evolution 39:783-791.
3. Kimura M. (1980). A simple method for estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences. Journal of Molecular Evolution 16:111-120.
4. Nei M. and Kumar S. (2000). Molecular Evolution and Phylogenetics. Oxford University Press, New York.
5. Saitou N. and Nei M. (1987). The neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic trees. Molecular Biology and Evolution 4:406-425.
6. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., and Kumar S. (2013). MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. Molecular Biology and Evolution30: 2725-2729.

List with GenBank Sequences
Datum
Källa Eget arbete
Skapare Thkgk
Tillstånd
(Återanvändning av denna fil)
Jag, upphovsrättsinnehavaren av detta verk, publicerar härmed det under följande licens:
Creative Commons CC-Zero Denna fil har gjorts tillgänglig under licensen Creative Commons CC0 1.0 Universal Public Domain Dedication.
Personen som kopplade ett verk till detta dokument har tillägnat arbetet till Allmänheten genom att, i den utsträckning som tillåts i lag, avstå från alla sina rättigheter till verket i hela världen som han eller hon skulle haft för verket enligt upphovsrätten och alla relaterade eller närliggande juridiska rättigheter. Du kan kopiera, modifiera, sprida och visa upp verket, även för kommersiella ändamål, utan att fråga efter godkännande från upphovsmannen.

Bildtexter

Ingen bildtext har definierats

Objekt som porträtteras i den här filen

motiv

image/svg+xml

4485df159f05173e4e0f7d31ec25abf057c8b368

20 617 byte

415 pixel

481 pixel

Filhistorik

Klicka på ett datum/klockslag för att se filen som den såg ut då.

Datum/TidMiniatyrbildDimensionerAnvändareKommentar
nuvarande5 september 2014 kl. 11.07Miniatyrbild för versionen från den 5 september 2014 kl. 11.07481 × 415 (20 kbyte)Thkgk{{Information |Description=Figure. '''Evolutionary relationships of ''Boidinia'' and ''Gloeopeniophorella'' '''<br/> The evolutionary history was inferred using the Minimum Evolution method [1]. The optimal tree with the sum of branch length = 0.442966...

Följande sida använder den här filen:

Global filanvändning

Följande andra wikier använder denna fil:

Metadata